Allgemeine Mikrobiologie und Biotechnologie

Die Abteilung verfolgt Forschungsaktivitäten im Bereich der Biofilmforschung, der mikrobiellen (Meta-)Genomforschung und der Biokatalyse bzw. der weißen Biotechnologie.

Forschungsschwerpunkte

Biofilmforschung

  • Typisierung und Charakterisierung  von industrie-nahen und technischen Biofilmen
  • Entwicklung neuer Strategien zur Inhibition von mikrobiellen Biofilmen
  • Analyse von Quorum-Quenching– und Quorum-Sensing Mechanismen in Bakterien
  • Identifizierung, Charakterisierung und Nutzung  von Enzymen und anderen Biomolekülen zur Inhibition von mikrobiellen Biofilmen
  • Transkriptom und Proteomanalysen in Biofilm-Modellorganismen (z.B. Pseudomonas aeruginosa)

Metagenomik - Genomik

  • Etablierung von Metagenombanken mikrobieller Biofilme und Konsortien
  • Entwicklung von Durchmusterungsverfahren (Mikrotiterplatten-, TLC-basierte oder genetische Verfahren)
  • Etablierung neuer Wirtssysteme zur Durchmusterung von Metagenombanken

Biokatalyse

  • Identifizierung und Charakterisierung neuer Biokatalysatoren für die Bioindustrie (.z. B. thermostabile Lipasen, Esterasen, Glycosyltransferasen, etc. ).
  • Strukturaufklärung von neuartigen Biokatalysatoren in Zusammenarbeit mit dem DESY.

Geräteausstattung

Die Labors der Abteilung sind für Arbeiten mit Mikroorganismen der Sicherheitsstufen S1 und S2 ausgestattet.

Darüber hinaus verfügt die Abteilung über eine gute Analytische Ausstattung mit mehreren HPLCs  und TLC-Geräten, sowie Mikrotiter-Plattenlesegeräten.

Zur Darstellung von Proteinen ist die Abteilung mit div. FPLC-Geräten ausgestattet.

Zudem sind wir mit zwei Fluoreszensmikroskopen ausgestattet, die die Darstellung mikrobieller Biofilme in dreidimensionaler Form ermöglichen und haben Zugriff auf ein konfokales Mikroskop.

Im Bereich der DNA Analytik verfügt die Abteilung über einen Microarray Reader,eine Hybridisier-Station sowie eine RT-PCR.